CertiQ heeft geen winstoogmerk, maar werkt kostendekkend. Tekorten en overschotten uit een jaar worden in de tarieven van volgende jaren verwerkt. De tarieven worden jaarlijks vastgesteld door de directie van TenneT, na overleg met de Deelnemersraad van CertiQ.

Voor het jaar 2012 gelden de volgende tarieven:

Tarieven producent
Voor producenten worden geen inschrijvingskosten in rekening gebracht. Het jaarlijkse lidmaatschap bedraagt €29,75 inclusief BTW per installatie. Als een installatie slechts een gedeelte van een kalenderjaar ingeschreven staat, wordt de hoogte van het jaarlijkse lidmaatschap niet aangepast.

Voor de categorie zon gelden geen inschrijvingskosten en ook geen jaarlijkse lidmaatschapskosten.

Tarieven handelaar
Voor 2012 gelden geen inschrijvingskosten voor handelaren. Het jaarlijkse lidmaatschap is ten opzichte van 2011 verlaagd en bedraagt met ingang van 1 januari 2012 € 500,- per account, ongeacht het aantal transacties.

Transactietarieven voor handelaren
De in 2011 gehanteerde korting van 35% voor afboeken en aanmaak  is voor 2012 structureel gemaakt. Hieronder volgt een overzicht van de kosten per MWh voor de handel in certificaten. 

Hieronder volgt een overzicht van de kosten per MWh voor de handel in certificaten: 

Overzicht tarieven 2012